Diferente do primeiro turno, apenas os dados das mídias de resultado são inseridos nas urnas, reunindo informações sobre os candidatos que estão disputando a eleição, os dados das seções e dos eleitores. Após esse procedimento, todos os componentes são testados para verificar se a urna está pronta para funcionar no dia da eleição. A visibilidade da tela, o teclado e o som dos equipamentos, por exemplo, passam por testagens.

Ao final desse processo, o compartimento da mídia de resultado é lacrado novamente e a urna está pronta para ser embalada e distribuída.

No interior - com 17.561 urnas de seção e, aproximadamente, 2.319 de contingência - o cronograma é definido pelas zonas eleitorais e a distribuição aos locais de votação é feita apenas na véspera da eleição.

Assim como na fase de geração das mídias, a cerimônia de preparação das urnas é aberta às entidades de fiscalização, partidos políticos, coligações e federações de partidos. De acordo com Lorena Belo, secretária de Tecnologia da Informação do TRE-CE, há a possibilidade de que, pelo menos, um representante das Forças Armadas acompanhe o processo.