A principal forma de manutenção da atividade das unidades de saúde é a transferência de recursos feita pelo Ministério da Saúde, especialmente dedicada às atividades filantrópicas e beneficentes. Segundo o provedor, a receita mensal atual da instituição é R$ 3 milhões, que não é o suficiente para cobrir todas as despesas, que chegam a até R$ 5 milhões todos os meses. 

Além dessa contribuição, a Santa Casa de Misericórdia de Fortaleza recebe auxílio da população por meio de doações feitas com as contas de água e de luz. Essa arrecadação, segundo Marquez, reúne aproximadamente R$ 400 mil mensalmente. 

Os incentivos governamentais ao qual o provedor se referiu foram prometidos pelo presidente Jair Bolsonaro, em nove de abril deste ano. Os recursos, cerca de R$ 3,8 bilhões, seriam transferidos das fontes que iriam financiar o Projeto de Lei Paulo Gustavo para o agronegócio e para as Santas Casas.